Substancje, które mogą hamować koronawirusa. Nowe wyniki badań polskich naukowców

Powiązany Artykuł

Aspiryna może chronić przed ciężkim przebiegiem COVID-19. Nowe wyniki badań

Wyniki prac zostały opublikowane w "International Journal of Molecular Sciences".

Białko odpowiedzialne za obniżanie odporności organizmu i sprzyjające replikacji koronawirusa to PLpro i jest znane naukowcom od 2003 r., kiedy wybuchła epidemia SARS. Poprzez "atakowanie" białka PLpro różnymi związkami chemicznymi można szukać leku na chorobę COVID-19, wywoływaną przez koronawirusa SARS-CoV-2.

• Zbadano skuteczność sposobów leczenia COVID-19. Naukowcy opracowali nowy matematyczny model
• Badania nad koronawirusem. Opóźnienie leczenia nowotworu zwiększa ryzyko zgonu

- Różne grupy naukowe szukały już związków, które działałyby jak leki na SARS-CoV-2. Do tej pory wyniki nie były satysfakcjonujące, dlatego wciąż szukaliśmy lepszych rozwiązań. Mieliśmy częściową wiedzę na podstawie wirusa SARS-CoV-1, który jest bardzo podobny. Nasze podejście różniło się dokładnością. Samodzielnie sprawdziliśmy też, czy wyselekcjonowane związki nie są potencjalnie toksyczne dla ludzkiego organizmu - mówi Adam Stasiulewicz, doktorant z Interdyscyplinarnego Laboratorium Modelowania Układów Biologicznych CeNT UW i Zakładu Chemii Leków Warszawskiego Uniwersytetu Medycznego, pierwszy autor artykułu.

REKLAMA

Naukowcy wykorzystali metodę "machine learning" - czyli sztuczną inteligencję, która korzystając z algorytmu, automatycznie poprawia swoje rezultaty poprzez nabywane doświadczenie.

- Wiedza fizyczna, biologiczna, chemiczna i farmakologiczna pozwoliła nam uchwycić, wydaje się unikalne oddziaływania, które mogą być kluczowe w celu zaprojektowania cząsteczki pełniącej funkcję inhibitora. Robiliśmy to masowo, ale jednocześnie bardzo dokładnie - patrzyliśmy, który klocek może pasować do innego klocka - tłumaczy prof. Joanna Sułkowska, kierująca Interdyscyplinarnym Laboratorium Modelowania Układów Biologicznych w CeNT UW, współautorka artykułu.

Powiązany Artykuł

Szczepionka Pfizera skuteczna na nowe mutacje koronawirusa. Są wyniki wstępnych badań

"Praca przebiegała wieloetapowo"

Prof. Sułkowska podkreśla, że komputer przetwarzał dane, ale selekcji dokonywał zespół badaczy, a więc było w tym procesie dużo indywidualnej pracy ludzkiej.

- Praca przebiegała wieloetapowo. Zaczęliśmy od 15 milionów związków, które analizowaliśmy za pomocą zaawansowanych narzędzi bioinformatycznych, jednak na każdym etapie to człowiek musiał podjąć decyzję, w którym kierunku i jak ma przebiegać kolejna iteracja. W ten sposób wyselekcjonowaliśmy 1000 związków, a na końcu pulę zawęziliśmy do 400 - precyzuje prof. Sułkowska.

REKLAMA

Naukowcy z Uniwersytetu Warszawskiego ściśle współpracują z zespołem prof. Marcina Drąga z Politechniki Wrocławskiej. W 2020 r. prof. Drąg z zespołem rozpracował działanie dwóch enzymów - proteazy SARS-CoV-2 Mpro i SARS-CoV-2-PLpro, których zablokowanie za pomocą odpowiedniego związku może powodować zahamowanie działania wirusa.

Testy laboratoryjnie

Obecnie założenia teoretyczne badaczy z UW są testowane laboratoryjnie. - Teraz wyniki naszych badań sprawdzamy doświadczalnie wraz z zespołem prof. Marcina Drąga z Politechniki Wrocławskiej, na podstawie grantu z European Molecular Biology (EMBO) na zakup kilku cząsteczek - mówi prof. Sułkowska.

Badania teoretyczne zostały sfinansowane z grantu NCN "Szybka ścieżka dostępu do funduszy na badania nad COVID-19".

REKLAMA

***

pb